怎么一步一步从零开始阅读医学文献?

提到阅读文献,每个大能都有自己的个性化阅读方法。作为英语不好的医学初学者,该如何选择适合自己的文献阅读方法,提高文献阅读效率,提升文献精准查找速度?下面大家就交大家怎么一步一步从零开始阅读医学文献? 从研究没有开始直到研究做完,从头到尾,你都离不开查
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  提到阅读文献,每个大能都有自己的个性化阅读方法。作为英语不好的医学初学者,该如何选择适合自己的文献阅读方法,提高文献阅读效率,提升文献精准查找速度?下面大家就交大家怎么一步一步从零开始阅读医学文献?

  从研究没有开始直到研究做完,从头到尾,你都离不开查阅文献。查阅文献是为了不重复别人的工作,为了激发新的想法,为了站到本领域的前沿。如果你一年不看文献,那么,你已经在这个领域里out了。清华大学生命科学学院王继纵说,像《细胞》、《自然》、《科学》这三本杂志基本是他每天都需要专门规划时间来阅读的,研究领域内国际期刊的最新研究成果能让他不断开拓眼界。希翼你养成文献阅读的良好习惯,熟知如何将文献内容转化为内在的科研思维,并运用到论文写作中。

  一、文献阅读的正确姿势

  初看文献的三个步骤:

  1.先通读各个小标题,也就是results部分,弄清楚文章的思路和内在联系。

  2. 看每个小标题对应的结果图和图注,了解文章通过什么手段来验证科学假设,不明白的地方进行标记。

  3. 最后再把全文通读,根据做好的标记到文中找具体的解答,做好阅读摘要,注意编辑在discussion部分的写作方式和经典句式。

  通读文章前需要准备的问题:

  1.文献解决了什么问题?是否发现了新的机制、新的biomarker还是新的药物作用靶点等等。

  2. 这个问题重要么?为何重要?这点在introduction里面编辑会提出交代,即文章研究的背景和意义。

  3. 编辑提出了什么假设来解决上述问题?理论依据是什么?

  4. 编辑通过哪些方法来验证他们的假设?你还知道其他什么方法?要注意你的实验室/你手头上可以实现其中哪些方法,以后遇到此类的问题就可以采用啦。

  5. 这些方法是否符合论证假设的需要? 是否不够全面还可以有其他的补充?还要考虑实验材料涉及到哪些?细胞、动物、临床是否都覆盖到了?

  6. 编辑为什么这样设计实验?有什么创新?实验证据是如何一步步得出的?7. 所有的实验结果图都可以看懂吗?

  8. 文章是如何描述结果、如何解析图表趋势,论据如何组合,如何表达自己的观点?9. 写作上的亮点有哪些?

  10. 文献的总思路图?(问题、设计、方法和讨论的逻辑关系是什么)

  看完思考文献还没有解决的问题?即文献的减分项,机制是不是做的不透,创新性是否不足。要是自己接着此方向继续做,哪些是在我所在工作条件下可以做的,哪些必须要做,哪些别人肯定比我做得更好更快?

  有人说过一篇文献最重要的部分依次是:图表,讨论,文字结果,方法,这也是不无道理的。对一个领域熟悉之后,能做到仅通过阅读图表及其说明文字即能把握文章的方法、结果,在最短的时间内把握最必要的信息的要求。

  或者发展到定期查新得到的文章只须看摘要、图表即可,个别涉及新方法或突破性结果,再看讨论,文字结果和方法。如果时间充裕,discussion部分还是要重点研读一下,特别是遇到CNS级别的paper的时候。这部分会把文章的精髓,idea的创新性,编辑的实验设计逻辑再阐述一遍,图表的趋势解析,论据的组合,写作的亮点都是可以学习的地方。

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  二、文献精读的三种思维文献

  精读是科研人必不可少的功课。精读的主要目的是要把文章的内容真正消化掉,要转化为你自己可以运用的东西。精读的方式分为三种,它们包括"验证型阅读"、"挑刺型阅读"和"总结归纳型阅读".

  1.验证型阅读--模仿者这时候,你的角色是一个模仿者。就是拿到一篇好文章,暂不看文字内容,先把图和表挑出来,根据图和表的内容想想你来写这篇文章,你会怎么写,包括大的结构框架、组织逻辑,以及如何引入问题,如何进行结果陈述,如何引申出结论等,然后再看编辑是怎么做的,反复体会你想的和你看的有哪些不同。当你的想法和编辑的雷同程度越来越高,你的水平也在不知不觉之中越来越高。这种"图表--思索--验证"的阅读对提升思维非常有效。当你做实验后得到的就是几个表、几个图,如果有意识地经过了"验证型阅读"的训练,你就会知道该怎么从更高、更好的角度来写你的文章。同样的数据,有的人可以发10.0的文章,有的人可能只能发5.0的文章,为什么有这种差别?这种差别其实就是在平时阅读文献的过程中慢慢积累出来的。

  2.挑刺型阅读--评论者这时候,你的角色相当于一个评论者了。是一种更高层次的精读方式,需要有评论的一些基础。挑刺就是找不足,能挑刺说明你不仅消化了文章的内容,而且还能比编辑看得更深、更远。很多高档次杂志经常会刊出针对新文章的评论性短文,这实际上就是一种挑刺型阅读。"挑刺型阅读"可以提供新的研究思路,如果你立志于从事科学研究,撰写课题申请书是必须的能力之一。课题申请最重要的就是有新的idea,"挑刺型阅读"可以为你今后从事科学研究的选题提供良好的训练。

  3.归纳总结型阅读--专家型这时候,你的角色则是一个高屋建瓴的专家了,是一种宏观视野下阅读,是对多个"单"研究的归纳性思考,是对本领域的研究现状和发展趋势的总结和把握。每个人都可以总结,但要真正总结到位并对发展趋势进行合理、准确的预测却需要很强的能力,一般初涉研究的硕士很难达到这一水平,"大牛"才能很好地做到这一点,不是大牛,不是专家也没关系啦,因为大牛不是天生的,也是从研究生开始慢慢修炼出来的,你可以尝试性按照这种思维去做,量变到质变,说不定哪一天你成大牛了。这三种精读的思维模式,也反映了大家文献阅读的三种境界,某一天,你对归纳总结型阅读已经游刃有余了,那么恭喜你,你成为"大牛"了。

  三、如何总结和整理学术文献?

  说起文献管理App,就不得不想到Endnote,它可以帮助大家有效方便的进行文献的整理和分类。今天在这里除了先容Endnote,再给大家先容一款国产App--NoteExpress,希翼可以帮助到大家。多图预警,建议收藏慢慢看。

Endnote

  Endnote官网(https://endnote.com/)提供了endnote的下载权限以及多种期刊的投稿格式。各个大学的图书馆均为在校生提供了endnote的免费下载版本,很多网站也提供了endnote X9的破解版和安装说明。大家根据自身情况进行下载安装即可。需要注意的是。Endnote安装前要确保首先安装了WordApp。

  安装完endnote之后会在word中出现一个新的面板。

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  如果安装完endnote,在word中没有找到这个endnote面板,可以自行手动添加这个endnote插件。点击"文件-选项-加载项-转到-勾选Endnote选项",即可完成手动添加步骤。

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  1. 文献的分组创建 手动进行分组。鼠标左键双击my groups可以对总的组别进行重命名

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  鼠标右键单击,可以创建、删除新的群组集或群组。

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  将要导入该群组的文献选中,点击Add references to-目标群组名,即可完成文献的分类。如果删除群组名时,只会取消群组的分类,不会删除群组中的文献。

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  上面大家先容了手动进行文献分类,大家也可以用智能分组的方式,自动检索符合条件的文献信息,进行智能分类。选择create smart group,可以对这个分组进行命名,搜索符合条件的文献题目关键词,发表年份等信息。

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  2. 重复文献的查找与剔除 选择References-find duplicate,即可出现相同文献的对比,选中重复的文献,按delete键删除,再在trash中清空回收站,即可完成文献的彻底删除。

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  有时候,相同的文献,因为个别信息的不一致,未被筛选出来作为重复文献,这需要大家对重复文献的筛选条件进行进一步设置。选择Edit-preferences-在弹出的对话框中选择duplicate,即可对文献重复的标准进行设置。

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  3. 参考文献的导出 将要导出的文献条目选中,点击File-export,可以设置导出文献文件的名字,保存类型,这里Endnote有四种保存类型可以选择,大家根据自己实际需要进行设置。特此说明一下,如果要保存Endnote图书馆全部的参考文献,不需要提前选中文献,或者把export导出的对话框中的exported selected preferences前面的对勾去掉。

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  4. 文献数据库的压缩与解压缩 压缩选择File-compressed library,对弹出的对话框进行设置,即可完成压缩文献数据库。

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  解压缩文献数据库,选中文献数据库进行双击,即可完成文献数据库的解压。

  5. 在搜索引擎下载参考文献 下面是几种常见搜索引擎的参考文献条目下载先容。

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  在文献官网直接下载参考文献。

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  6. 借助查找全文功能下载PDF全文 可以先选中要下载全文的文献,再通过"References-Find Full text"菜单或者快捷键按钮直接下载PDF全文。有两个因素需要注意:其一,数据库中需收录该文献的全文;其二,本机的IP需要有权限下载全文。

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NoteExpress

  相比Endnote,这款App更优秀的地方在于更优化地中文文献的自动更新、期刊影响因子的显示、强大的笔记功能等。 NoteExpress的下载地址:http://www.inoteexpress.com/support/cgi-bin/download_sch.cgi?code=ZGYiKeYuan1. 建立个人文献数据库 首先打开NoteExpress应用程序,得到如下的窗格界面。

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  然后将文献导入,建立自己的文献数据库。

  中文数据库使用:比如万方数据库。以搜索"登革热病毒"为例。

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  将文献导出后,以右键添加子文件夹的形式添加自己所需的文件。比如下图。

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  做好自己的文件夹就可以右键点击"导入题录"的方式将文献导入到NoteExpress.如下图。

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  英文数据库使用:比如PubMed.以搜索dengue virus为例。

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  2. 文献管理 获得文献后,根据文献的类型、重要性等进行管理,NoteExpress的文献管理功能丰富实用。

  根据所读文献的种类有自定义的期刊或论文等的分类;根据文献数据库中文献是否已经阅读,用有色圆点标注;根据文献重要性和相关性,用星级和小红旗表示;这些功能便于快速查找所需文献。

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  NoteExpress的文献笔记功能和相应的下方"预览""综述"等界面设置有其方便性(个人感觉比Endnote右方的界面好操作)

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  显示期刊影响因子和权威数据库收录信息等。在NoteExpress表头右键选择"自定义",即出现下表。

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  选择影响因子等需要的显示信息,添加到表头。

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  NoteExpress表头的各个标题可以右键选择排序标准,比如按照影响因子降序,方便优先阅读重要的文献。

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  3. 写作 将鼠标放在需要添加文献处,点击NoteExpress图标。

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  点击"转到NoteExpress"

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  选中需要添加的题录。

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  回到文档,点击插入引文。

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  参考文献格式化,单击格式化进行格式选择。

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  除此之外,NoteExpress还有很多其他实用的功能,摸索地使用下来,个人感觉比其他文献管理App操作简单。

  在科研生活中,免不了与文献打交道,甚至是天天读文献、分析文献的套路、利用文献写文章,那么这一款文献管理AppNoteExpress,你值得拥有。

  四、哪些渠道去了解领域最前沿的动向和发展?

  1. 基金资助项目检索

  根据国家资助机构资助的项目得到未来三五年的研究主题,比论文更加具有前沿性。比如,大家进入到大家国家的国家科学基金共享服务网: http://output.nsfc.gov.cn/资助项目检索,输入自己相关领域的关键词,得到检索结果,从这些正在进行的项目中,大家可以看到在RNA的检索结果中,关于RNA方面的哪些内容还在研,甚至通过结题的项目查询,大家也能找到哪些内容可能已经过时了,以此找到一些线索和热点。

  同样,大家也可以进入美国国立卫生研究院

  网站:https://projectreporter.nih.gov/reporter.cfm

  根据基金查询,了解到近年资助基金的内容,获知时效的前沿热点。

  除开这两个获知基金信息的网站之外,还有英国国家研究理事会、美国国家科学基金会、日本学术振兴会、法国国家科研署等均可以查询,筛选检索就能得到前沿热点。

  2. 数据库(WOS、GOOGLE学术、百度学术等)

  特色功能检索通过查询论文的被引频次可以获悉该论文的价值,那么同样,通过高居不下甚至不断增加的被引频次,大家可以认为这个研究领域也是热点。

  举个栗子: 大家找到青蒿素这个关键词,在很早之前屠呦呦教授在药学学报上发表关于青蒿素的文章,之后有一篇Science的文章引用了该文章(如下图)。而这篇Science文章的被引达到2013次,且每年的被引次数都很高,值得注意的是,在这些被引文章中,也有非常多发表在高分优等杂志上。这说明什么呢?说明青蒿素的研究从最初屠呦呦的中文文章开始,就是面向重大需求的前沿工作。

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  按照这样的方式,大家也会很容易找到自己目前做的工作是否还能紧跟前沿热点的大流。综上:想要做科研,且要做好的科研,不知道前沿热点是万万不能的,那么除开上面两大找到科研热点的方法外,也可以通过智库报告、文献分析等找到,但是个人认为最简易快速的方法也就这两个了,走上做科研的大道,望各位同行都能紧跟前沿热点,实验棒棒棒,文章发发发!

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